ある日、学がALCAから失踪する事件が起きる。学の哀しい生い立ちを知った美親は、彼女との距離を縮めようと努める。心を閉ざした学は、かつて美親が実行した禁断の合体(トランス)“オーバートランス”について興味を抱く。そんな中、蛇神ケツァルコアトルの襲来によって発電所は占拠、街は大規模停電に陥る。近距離戦では歯が立たないケツァルコアトルに対抗するため、街の命運は学に託される──。